强奸罪一般要证明两点:一是发生了性关系;二是违背了妇女的意志。证据就要围绕这两点形成证据锁链。可以从女方处提取遗留精斑或残留精液,从受害人身上提取嫌疑人留下的线索,包括毛发、皮屑、体液(含汗水、口水、血液)、纤维等,环境许可还可考虑指纹、掌纹、脚印等许多线索,通过司法机关鉴定,可以确定是否是实施强奸的男性所为;这就证明了第一个问题。
至于违背妇女意志的事实证明,主要的证据有被害人的陈述,犯罪嫌疑人自己的供述。
【法律依据】
《刑事诉讼法》第五十五条第二款规定,证据确实、充分,应当符合以下条件:(一)定罪量刑的事实都有证据证明;(二)据以定案的证据均经法定程序查证属实;(三)综合全案证据,对所认定事实已排除合理怀疑。

1、受害人报案时,可以提供强行发生关系的直接证据,同时要有证据证明,受害人和对方发生性关系是违背受害人意愿的。若现场遗留物,嫌疑人的毛发,留有嫌疑人体液的物品等,可以提交给公安机关。具体的证据收集和搜查工作由办案机关完成。
2、【法律依据】
3、《刑事诉讼法》第一百一十五条规定,公安机关对已经立案的刑事案件,应当进行侦查,收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。对现行犯或者重大嫌疑分子可以依法先行拘留,对符合逮捕条件的犯罪嫌疑人,应当依法逮捕。
强奸罪直接证据和间接证据的区别在于:
1、对案件主要事实的证明是否具有直接性;
2、取证的难易程度不同;
3、对于其他证据的依赖性不同;
4、证明过程的复杂程度不同。
【法律依据】
《刑法》第236条第一款规定,以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的,处3年以上10年以下有期徒刑。
告强奸罪的证据除了强行发生关系的直接证据外,同时也要有证据证明,你和对方发生性关系是违背你的意愿的。如身上的伤痕、现场遗留物,嫌疑人的毛发,留有嫌疑人体液的物品等。
《刑事诉讼法》第50条规定:可以用于证明案件事实的材料,都是证据。证据包括:
(一)物证;
(二)书证;
(三)证人证言;
(四)被害人陈述;
(五)犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解;
(六)鉴定意见;
(七)勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录;
(八)视听资料、电子数据。
证据必须经过查证属实,才能作为定案的根据。