缴增值税额计入应交税费科目，应交税费，总括反映各种税费的缴纳情况，并按照应交税费项目进行明细核算。
减免增值税计入营业外收入科目。
根据财政部印发《关于小微企业免征增值税和营业税的会计处理规定》小微企业在取得销售收入时，应当按照税法的规定计算应交增值税，并确认为应交税费。在达到规定的免征增值税条件时，将有关应交增值税转入当期营业外收入。 增值税是价外税，在取得收款时，应将收款区分收入与应交增值税分别入账，这样能正确核算业务收入。当应交增值税免税时，属于一种国家补助性质的利得，按会计准则应该计入营业外收入科目。
转让土地增值税根据情况不同计入不同的会计科目。
（1）兼营房地产业务的企业，按应交的土地增值税记入“营业税金及附加”。
（2）企业转让土地使用权应交的土地增值税，土地使用权与地上建筑物及其附着物一并在“固定资产”等科目核算的，借记“固定资产清理”等科目，贷记“应交税费——应交土地增值税”科目。
（3）土地使用权在“无形资产”科目核算的，按实际收到的金额，借记“银行存款”科目。按摊销的无形资产金额，借记“累计摊销”科目，按已计提的无形资产减值准备，借记“无形资产减值准备”科目，按无形资产账面余额，贷记“无形资产”科目，按应交的土地增值税，贷记“应交税费——应交土地增值税”科目，按其差额，借记“营业外支出”科目或贷记“营业外收入”科目。
转让厂房缴纳的土地增值税计入固定资产清理科目。
企业转让的国有土地使用权连同地上建筑物及其附着物一并在“固定资产”或“在建工程”、“专项工程支出”、“固定资产购建支出”等科目核算的，转让时应交纳的土地增值税，借记“固定资产清理”、“在建工程”、“专项工程支出”、“固定资产购建支出”等科目，贷记“应交税金——应交土地增值税“科目。
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